L'histoire commence dans un bâtiment désert par une nuit noire. Une charmante demoiselle, Rin Asogi, est poursuivie avec acharnement par une tueuse féroce. Celle-ci parvient à la faire tomber du toit et le corps de Rin s'écrase en morceau sur le sol.

On retrouve Rin dans une agence de détective privé avec son assistante Mimi qui lui demande de prendre au sérieux son travail et de partir à la recherche du chat égaré d'un client. Alors que Rin est sur le point de le retrouver, ce bête chat ayant été responsable d'un carambolage, elle croise par hasard et sauve Maeno Koki, un jeune homme sur le point d'être enlevé par la mafia. Celui-ci lui fera part de son étrange malaise : il a le sentiment que tout ce qu'il entoure, tout ce qu'il vit est faux et que ses souvenirs ont été fabriqués tellement ils lui semblent artificiels.

L'histoire est centrée sur trois jeunes lycéens qui vivent dans la petite ville reculée de Suiten, au nord de l'île de Kyushu, et qui partagent une étrange amnésie. En 1996, Tarō Komori et sa sœur Mizuka ont été enlevés à la sortie de l'école alors qu'ils étaient enfants. Si Tarō a pu être retrouvé vivant, Mizuka n'a pas eu cette chance et est morte de faim et de déshydratation, la police retrouvant finalement leur trace dans un hôpital abandonné. Toujours perturbé par cette douloureuse expérience onze ans plus tard, Tarō cherche cependant à comprendre ce qui s'est passé pendant qu'il était séquestré. Il semble également que deux élèves (Masayuki et Makoto) de son école et une jeune écolière (Miyako) soient liés à lui pour différentes raisons. À la suite d'un accident, la frontière entre le monde des esprits et celui des humains commence à disparaître, ouvrant la voie aux fantômes et autres divinités. Les trois garçons partageront alors ensemble une expérience hors du commun : la projection astrale qui leur permet de « sortir de leur corps ». Une nouvelle vision du monde où les esprits vagabondent s'ouvre ainsi à eux. Mais parviendront-ils à rétablir le fragile équilibre ?

Sato Koharu est une jeune fille dont la beauté est appréciée par tous ses camarades de classe. Mais elle est aussi réputée pour se montrer toujours très froide avec eux. D'innombrables personnes ont été brisées par sa froideur alors qu'elles essayaient de la connaître. Mais un jour, Oshio, un garçon de sa classe, tombe sur elle par hasard lors de son travail à temps partiel, et la sauve des avances de dragueurs un peu trop insistants. Depuis, elle semble s'être prise d'affection pour lui. Oshio se retrouve alors à l'aider à prendre de belles photos pour ses réseaux sociaux. L'impassible Sato devient ainsi avec lui une douce et adorable personne au sourire enchanteur.