L'histoire commence dans un bâtiment désert par une nuit noire. Une charmante demoiselle, Rin Asogi, est poursuivie avec acharnement par une tueuse féroce. Celle-ci parvient à la faire tomber du toit et le corps de Rin s'écrase en morceau sur le sol.

On retrouve Rin dans une agence de détective privé avec son assistante Mimi qui lui demande de prendre au sérieux son travail et de partir à la recherche du chat égaré d'un client. Alors que Rin est sur le point de le retrouver, ce bête chat ayant été responsable d'un carambolage, elle croise par hasard et sauve Maeno Koki, un jeune homme sur le point d'être enlevé par la mafia. Celui-ci lui fera part de son étrange malaise : il a le sentiment que tout ce qu'il entoure, tout ce qu'il vit est faux et que ses souvenirs ont été fabriqués tellement ils lui semblent artificiels.

Trois lycéennes, Hikaru Shidou, Umi Ryuuzaki et Fû Hououji, se rencontrent pour la première fois lorsqu’un événement mystique vient bouleverser leur réalité. Une voix féminine, accompagnée d’un flash de lumière, les implore de sauver le Royaume de Cefiro, menacé par une force obscure. Propulsées dans un monde fantastique, elles découvrent qu’elles sont les légendaires « Magic Knights », invoquées par la princesse Émeraude afin de restaurer la paix et l’harmonie à Cefiro.

Guidées par Clef, un mystérieux mentor, elles apprennent qu’elles ne pourront rentrer chez elles qu’après avoir accompli leur destinée. Pour y parvenir, elles doivent libérer la princesse Émeraude des griffes du redoutable grand prêtre Zagato et affronter les créatures maléfiques qui envahissent le royaume. Coincées, Hikaru, Umi et Fû acceptent la mission qui leur est confiée et reçoivent chacune une armure ainsi que des pouvoirs magiques pour mener à bien cette périlleuse quête…

La lycéenne Sawako, qui doit son surnom "Sadako" à son apparence sinistre, sort de sa coquille lorsqu'elle se lie d'amitié avec Kazehaya, un garçon populaire.

Moriko Morioka a 30 ans, elle est célibataire. Elle est surtout ce qu’on appelle une « NEET » (Not in Education, Employment or Training). Complètement déconnectée du monde réel, elle a trouvé refuge dans le monde d’un jeu vidéo en ligne, le seul endroit où elle se sent bien ! Là, elle commence une nouvelle vie sous les traits d’un séduisant jeune homme nommé Hayashi…

En dépit de la disparition tragique de ses parents, Himari, atteinte d’un cancer du cerveau en phase terminale, profite d’un bonheur précaire auprès de ses deux frères. Aux portes de la mort, la jeune fille est toutefois sauvée in extrémis par une mystérieuse entité résidant dans un chapeau en forme de pingouin, acheté auparavant dans un parc aquatique. Sa survie a pour autant un prix : assistés par trois facétieux pingouins, invisibles aux yeux du reste du monde, Kamba et Shôma devront mettre la main sur le « Penguin Drum », un objet réputé comme insaisissable.

Au milieu de la vie frénétique de Tokyo, la créatrice d'un personnage à la mode (le chien Maromi) est agressée devant chez elle par un jeune garçon portant une casquette, des rollers et une batte de base-ball dorés.

Deux inspecteurs de police, l'un jeune et enthousiaste, son aîné plus blasé, mènent leur enquête pendant que de nouvelles agressions ont lieu, toujours par celui que l'on nomme "le jeune homme à la batte". Alors que les victimes ne semblent posséder aucun lien entre elles, la paranoïa s'installe au sein de la population de la capitale...

Oyamada Kouta est un garçon très banal qui se rend à son nouveau lycée pour son premier jour quand tout à coup il se fait aborder par Chizuru Minamoto qui est la plus belle fille de l'école. Elle lui demande de sortir avec, Kouta se demande pourquoi lui, qui est elle réellement et pourquoi elle se fait passer pour une lycéenne...

Japon, 1374. Tandis que le pays subit les affres d’une guerre civile opposant les cours impériales du Nord et du Sud, Oniyasha, fils d’un maître de sarugaku, s’initie à la danse sans en percevoir la nécessité ni la beauté. Son existence bascule pourtant lorsqu’une jeune femme, pauvrement vêtue et dont les mouvements semblent d’abord maladroits, parvient à l’émouvoir avec une intensité qu’il n’avait encore jamais éprouvée. Dans ce monde traversé par l’instabilité et l’impermanence, l’adolescent devra peu à peu se confronter à ses propres faiblesses pour donner naissance à une forme de danse nouvelle…

Un jeune lycéen, Yuuji Sakai, voit le monde se figer autour de lui alors qu'il rentrait tranquillement de l'école. Apparaissent alors 2 monstres dévorant les gens, comme suspendus dans le temps, autour de Yuuji. Alors que le monstre s'intéresse à cet humain qui peut encore se déplacer, une jeune fille à l'aura de feu, une Flame haze, apparaît et tranche la Rinne, ainsi que Yuuji. Celui-ci découvre alors qu'il est déjà décédé et a été remplacé par une torche, une âme temporaire de substitution. L'amie qui l'accompagnait, Hirai, se révèle avoir été remplacée par une torche à la fin de ce combat. Celle-ci sombre peu à peu dans l'oubli collectif puis disparaît au bout de quelques jours, Shana ayant assisté à son évaporation récupéra un peu de sa flamme et prit sa place dans le monde des humains, depuis ses camarades de classe l'appelent Hirai sans avoir remarqué quelque différence avec la précédente Hirai. Paradoxalement, l'existence de Yuuji persiste. Shana, la Flame haze, doit alors veiller sur lui malgré son ennui car il s'agit d'un Mistes, renfermant un pouvoir puissant, un hougu du nom de Reiji Maigo, lui permettant de rallumer sa torche toutes les 24 heures, à minuit. De ce fait, son intégration à la classe de Yuuji l'aide fortement à être à ses côtés en permanence, elle se révèle également très intelligente et terrorise certains de ses professeurs. Yuuji, désormais certain de ne plus disparaître, décide de l'aider activement dans sa lutte contre les Tomogara no Guze, seigneurs d'un monde parallèle dont une partie utilise la force vitale des humains pour gagner en pouvoir.

Sora et Shiro, frère et sœur passionnés de jeux vidéo et incroyablement doués, se sont élevés au rang de légende urbaine tant ils restaient invaincus, mais ils ne sont aux yeux du monde extérieur que des NEETs et des Hikikomoris. L'apparition de Teto, un jeune garçon se faisant appelé « Dieu », va changer le cours des choses. Loin du monde réel considéré comme un « jeu pourri », Teto entraîne nos deux héros dans un univers parallèle où la violence est proscrite et où tout conflit se règle par une partie de jeu. Des 16 peuples vivant là-bas, les « Humains » sont les plus faibles. Suite à de trop nombreuses parties perdues, leur terre et leur nombre sont presque réduits à néant. Grâce à leur talent, Sora et Shiro pourront-ils inverser la tendance et sauver les Humains ?

Kagome, jeune Japonaise de 15 ans, mène une vie paisible au sein de sa famille auprès d’un temple de Tokyo jusqu’au jour où tombant dans un puits, elle fait un bond dans le temps et se retrouve à l’époque Sengoku dans un Japon où monstres et esprits malins abondent. Elle fait alors la rencontre d’Inu-Yasha, un être hybride tenant à la fois de l’humain, du chien et du démon. Celui-ci est à la recherche de la perle de Shikon. A la suite de péripéties, la perle de Shikon est éclatée et Kagome se retrouve en la possession d’un de ses fragments… Kagome et Inu-Yasha vont être contraints de faire équipe pour retrouver les parties manquantes de la perle de Shikon. Sans cesse oscillant entre Japon moderne et Japon féodal, l’aventure peut alors commencer !

Kenzo Tenma est un médecin japonais travaillant en Allemagne. En 1986, il décide de sauver la vie d'un jeune garçon, désobéissant ainsi aux ordres de son directeur qui lui demandait de sauver en priorité celle du maire de la ville. Quelques jours plus tard, le directeur et deux autres responsables de l'hôpital sont empoisonnés.

Neuf ans sont passées, en 1995, un événement similaire se produit et oblige Tenma à fuir. Sa fuite et sa quête de justice vont l'amener à découvrir une horrible vérité. Le jeune garçon qu'il avait sauvé dix plus tôt est en fait un véritable monstre : un être brillant, beau, mais avant tout un terrifiant tueur...