L'anime suit l'histoire d'un jeune étudiant anonyme pris dans une boucle temporelle lui faisant revivre ses deux années d'université. À chacune de celles-ci il rejoint un club différent pour tenter de vivre de manière insouciante et de trouver l'amour, sans y arriver…

Dans un monde parsemé d'horribles démons se délectant des âmes de leurs innocentes victimes, l'université Shibusen forme des chasseurs de démons, les Meisters. Chaque Meister se voit confier une arme qui a la capacité de prendre forme humaine ; on appelle ces armes des Soul Eaters, car elles se repaissent littéralement des âmes des démons (œufs de Kishin) qu'elles tuent. Une fois qu'un Soul Eater a mangé quatre-vingt-dix-neuf œufs de Kishin, il doit avaler une âme de sorcière afin de prétendre au titre de Death Scythe (« faux de la mort »)… C'est le but que poursuivent la jeune Maka (fille modèle d'une Meister et de son Soul Eater) et sa grande faux Soul, aux apparences de gamin rebelle et dont le but dans la vie est d'être le plus « cool » possible… Ce duo improbable sera bientôt rejoint par d'autres : Blackstar, le ninja égocentrique armé de la pulpeuse Tsubaki (une double-faucille reliée par une longue chaîne), et Death the Kid, le fils du fondateur de l'université Shibusen qui manie les sœurs Thompson lorsque celles-ci prennent la forme de revolvers.

Ère cosmique 70. La tragédie de la St-Valentin sanglante transforme les tensions qui existent entre la Terre et les PLANT en une guerre totale. Alors que tous prévoyaient une victoire de l’Alliance Terrienne, numériquement supérieure, les faits allaient démontrer le contraire. Onze mois ont passé depuis que le conflit s’est enlisé dans le statu quo. Kira, un jeune Coordinateur, vit et étudie avec ses amis Naturels sur Héliopolis. Leur quotidien sera chamboulé lorsque ZAFT attaquera la colonie censée être neutre…

Devenu vampire malgré lui à la suite d’un événement surnaturel, Koyomi Araragi, bien que désormais guéri, conserve les stigmates de cette transformation. Sa vie, en apparence ordinaire, bascule de nouveau dans le paranormal lorsqu’il sauve in extremis Hitagi Senjôgahara d’une chute mortelle. À sa grande surprise, il découvre que celle-ci est aussi légère qu’une plume. Habituellement taciturne, la jeune fille le menace de représailles s’il ose divulguer son secret. Refusant de rester impassible face à ce phénomène, Koyomi lui propose alors de l’aider à le résoudre.

2029, un Japon du futur proche. Le cyborg Motoko Kusanagi envisage une unité de lutte contre les menaces émergentes. Daisuke Aramaki recrute son équipe et forme la Section 9 de la Sécurité publique, alias l'« Unité spéciale ». Un complot se dessine et un hacker émerge : le « Marionnettiste ». Que réserve l'avenir à Kusanagi ? Que veut ce hacker ? Une nouvelle ère d'action cyberpunk commence !

Londres – XIX siècle. Après la mort inexpliquée de ses parents, Ciel Phantomhive, jeune garçon de 12 ans dirige l'entreprise familiale avec une habilité déconcertante. Sa réussite, il l'a doit avant tout à son majordome Sebastian Michaelis. Irréprochable, attentionné et véritable « cordon-bleu », il semble lié à Ciel par un pacte mystérieux. Ce diable de majordome est habile pour satisfaire son maître et beaucoup vont l'apprendre à leurs dépens…

Au pays de Clow, la princesse Sakura, amoureuse du jeune Shaolan, succombe à un mal mystérieux qui brise son âme en mille éclats, éparpillés dans de multiples mondes parallèles. La vie de Sakura dépend désormais de Shaolan. Afin de la sauver, ce dernier pactise avec la mystérieuse Yuko, qui pourrait bien l'aider à retrouver les éclats d'âme…

Nous sommes le 12 août. Après que la télécommande de son unique climatiseur a été détruite par inadvertance, "Je" élabore un plan pour retourner dans le passé de 24 heures avec une machine à remonter le temps, afin de récupérer la télécommande avant qu'elle ne se casse. Cependant, son ami Ozu ne peut résister à l'envie de jouer avec les événements passés, même si cela risque de détruire l'univers. "Je" doit se lancer dans une course contre la montre pour éviter la catastrophe.

Prestigieux lycée jouissant d’une excellente réputation, le lycée Ôran façonne l’élite de demain en y accueillant exclusivement les héritiers et les étudiants issus de la haute société. Pourtant, grâce à ses excellents résultats scolaires, Haruhi Fujioka, une élève d’origine modeste, a pu bénéficier d’une bourse lui permettant d’intégrer l’établissement. Mais un malencontreux accident la contraint à rejoindre le club d’hôtes, chargé de divertir les jeunes filles oisives. Pour s’acquitter de sa dette, Haruhi devra se faire passer pour un garçon et participer aux activités du club.