Alors qu’il sèche les cours, Takashi assiste, impuissant, à l’invasion de son lycée par ce qui semble être des morts-vivants. Réussissant à former un petit groupe de survivants, incluant Reï, son amie d’enfance, il tente d’échapper à la contamination, mais se rend vite compte que le monde entier est touché. Commence alors une longue bataille pour sa survie et celle de ses nouveaux camarades dans une ville de Tôkyô infestée de zombies.

Un jour, en rentrant de l'école, Konoha Koga sauve Satoko Kusagakure, une ninja qui s'est échappée de son village. Très vite, des poursuivants à la recherche de Satoko se présentent, mais Konoha s'en débarrasse habilement. Il s'avère que cette lycéenne d'apparence ordinaire est en fait un assassin. Ainsi commence une drôle de cohabitation entre une ninja et une tueuse !

Voici l’histoire de la famille Takayamadera en charge de Miroir-Ville au temps où un nombre incalculable de mondes se côtoyaient et où la frontière séparant les humains et les dieux était encore incertaine.

Il y a des années, la soudaine apparition des Gadolls, une forme de vie inconnue, a bien failli conduire à l'extinction du genre humain. Pour se protéger de la menace, les survivants ont trouvé refuge dans la forteresse mobile Deca-Dence, haute de 3 000 mètres. Deux sortes d'habitants existent : les Gears, des guerriers luttant nuit et jour contre les Gadolls, et les Tankers, des humains sans capacité à combattre. Natsume est une jeune Tanker qui entretient le rêve de devenir une Gear. Un jour, elle rencontre Kaburagi, un réparateur froid et brusque.

Yachi Haruaki, un jeune lycéen, reçoit un Cube Noir de la part de son père actuellement en voyage. Cette nuit-là, Yachi fut réveillé par d'étranges bruits provenant de la cuisine où il y fera la rencontre d'une voleuse entièrement nue mangeant des biscuits. Cette voleuse est la forme humaine du Cube Noir « maudit » au doux nom de Fear. Ensemble, ils vont essayer de lever la malédiction et lutter contre d'autres objets maléfiques voulant utiliser Fear pour de noirs desseins.

La journée avait mal commencé pour Ryû Yamada, qui s'est fait remonter les bretelles par son professeur. Un peu plus tard, il tombe dans les escaliers, entraînant dans sa chute la belle Urara Shiraishi. Dans l'action, ils se donnent même un baiser fortuit, et voilà qu'à présent, les deux lycéens ont échangé leur corps ! Avec deux personnalités aussi opposées, cela ne pouvait pas tomber plus mal. Et ce n'est que le début des ennuis pour Yamada qui va aller de surprise en surprise…

Bien que redouté par ses camarades en raison de son air patibulaire, Ryûji bénéficie toutefois du soutien indéfectible de son meilleur ami, Yûsaku, qui l’introduit auprès de la mystérieuse Minori, dont il tombe immédiatement sous le charme. Une série d’événements fortuits lui révèle alors que Taiga, sa nouvelle voisine et confidente de sa dulcinée, est secrètement éprise de Yûsaku. En dépit de leurs divergences, ces derniers concluent un pacte, afin de séduire les élus de leurs cœurs.