Comment le plus talentueux des assassins peut-il ne pas tuer quelqu’un ? Spécialement formé depuis son enfance pour devenir tueur à gages, l’invincible tueur connu sous le nom de Fable peut éliminer n’importe quel adversaire en moins de six secondes. Mais un jour, son patron lui ordonne soudain de ne tuer personne pendant un an et de vivre une vie ordinaire. Sous le nom d’Akira Sato, Fable accepte sa mission et commence à vivre la vie d’une personne tout à fait normale. Mais derrière cette vie paisible plane une sombre menace qui l’empêchera d’être tranquille.

Devenu vampire malgré lui à la suite d’un événement surnaturel, Koyomi Araragi, bien que désormais guéri, conserve les stigmates de cette transformation. Sa vie, en apparence ordinaire, bascule de nouveau dans le paranormal lorsqu’il sauve in extremis Hitagi Senjôgahara d’une chute mortelle. À sa grande surprise, il découvre que celle-ci est aussi légère qu’une plume. Habituellement taciturne, la jeune fille le menace de représailles s’il ose divulguer son secret. Refusant de rester impassible face à ce phénomène, Koyomi lui propose alors de l’aider à le résoudre.

Sora et Shiro, frère et sœur passionnés de jeux vidéo et incroyablement doués, se sont élevés au rang de légende urbaine tant ils restaient invaincus, mais ils ne sont aux yeux du monde extérieur que des NEETs et des Hikikomoris. L'apparition de Teto, un jeune garçon se faisant appelé « Dieu », va changer le cours des choses. Loin du monde réel considéré comme un « jeu pourri », Teto entraîne nos deux héros dans un univers parallèle où la violence est proscrite et où tout conflit se règle par une partie de jeu. Des 16 peuples vivant là-bas, les « Humains » sont les plus faibles. Suite à de trop nombreuses parties perdues, leur terre et leur nombre sont presque réduits à néant. Grâce à leur talent, Sora et Shiro pourront-ils inverser la tendance et sauver les Humains ?

Vivant recluse et préférant la compagnie des livres, la romancière Makio Kôdai apprend un jour la disparition brutale de sa sœur et de son beau-frère avec lesquels elle était en froid depuis plusieurs années. Par la force des choses, Makio devient alors la tutrice de sa nièce de 15 ans, Asa Takumi. Cette soudaine cohabitation va pousser les deux femmes aux personalités opposées à s'ouvrir.

Nozomu Toshiki est un professeur de lycée très pessimiste dont même les kanji de son nom forment le mot désespoir. C'est en tentant de se suicider en se pendant à une branche de cerisier qu'il rencontre Kafuka Fura, une jeune fille au caractère totalement opposé au sien. Celle-ci, le "sauve" en quelque sorte et lui explique qu'il ne faut pas se suicider en un si beau jour de printemps. D'une naïveté et d'un optimisme débordant elle croit même que, comme ses parents, Nozomu n'a pas tenté de se pendre mais plutôt de se faire grandir et lui donne le nom de "Sous-chef Rose". Exaspéré par cette fille au point de vue si différent du sien, Nozomu s'en va, renonçant pour un temps à se suicider mais il n'est pas au bout de ses surprises car c'est en classe qu'il retrouve Kafuka qui se révèle être une de ses élèves. Mais Kafuka n'est pas si différente de ses camarades, et le professeur désespéré va devoir faire cours à des élèves très spéciaux...