Dans le pays de Fiore, il existe parmi le commun des mortels des hommes et des femmes qui manipulent la magie : ils sont appelés des mages. Pour mieux les contrôler, des guildes ont été créées et mises sous la responsabilité du conseil des mages. Outre la nécessité de contrôle des mages, ce réseau a une autre utilité, en effet il permet de fournir un large choix de mages au client, et un large choix de missions au mage par le biais des avis. Parmi toutes ces guildes, une en particulier fait beaucoup parler d'elle : bien sûr par les actes réalisés par ses membres, mais aussi (et surtout) pour les dégâts collatéraux provoqués par ces mêmes membres à chaque mission qu’ils effectuent. Cette guilde s’appelle Fairy Tail. L'histoire se focalise notamment sur les missions effectuées par l'une des équipes de mages de Fairy Tail, composée de Natsu, Lucy et Happy, auxquels viendront se greffer assez rapidement Erza et Grey.

Il y a 800 ans, l’humanité était sur le point de disparaître, menacée par de terribles démons. Mais des divinités appelées les Idaten sont apparues et ont vaincu ces créatures après une lutte acharnée. Aujourd’hui, cette bataille est si loin qu’on l'évoque comme un mythe ou une légende. La nouvelle génération d’Idaten n’a jamais eu à se battre et profite d’une vie tranquille. Mais les démons viennent de se réveiller...

Devenu vampire malgré lui à la suite d’un événement surnaturel, Koyomi Araragi, bien que désormais guéri, conserve les stigmates de cette transformation. Sa vie, en apparence ordinaire, bascule de nouveau dans le paranormal lorsqu’il sauve in extremis Hitagi Senjôgahara d’une chute mortelle. À sa grande surprise, il découvre que celle-ci est aussi légère qu’une plume. Habituellement taciturne, la jeune fille le menace de représailles s’il ose divulguer son secret. Refusant de rester impassible face à ce phénomène, Koyomi lui propose alors de l’aider à le résoudre.