Bienvenue à Kura, une organisation qui enquête sur des crimes en utilisant le Mizuhanome, un système percevant l'envie de tuer. Rencontrez Sakaido, un détective brillant qui pilote ce système. Pour résoudre les mystères, il pénètre dans le monde de l'inconscient des meurtriers : le puits de ça, généré à partir de leur envie de tuer. Dans l'ombre de brutales et énigmatiques affaires rôde John Walker, un tueur en série particulièrement dangereux. Où sa traque emmènera-t-elle les enquêteurs ?

Un tremblement spatial massif dévaste le centre du continent eurasien, ôtant la vie à plus de 150 millions de personnes. 30 ans plus tard, un nouveau tremblement spatial se produit, sous les yeux d’Itsuka Shidô, un simple lycéen pas très doué en histoires de cœur. Il fait alors la rencontre d’une jeune fille qui s’avère être un esprit. Elle est un désastre qui menace l'humanité, un monstre d'origine inconnue, une existence rejetée par le monde. Pour s'en défaire, deux solutions : recourir à la force ou à la séduction. Shidô choisira la deuxième option. Entrez dans une nouvelle ère de drague !