Mikoto utilise son pouvoir de contrôle sur l'électricité pour aider à maintenir l'ordre dans la Cité Académique, qu'habitent surtout des étudiants psychiquement doués.

Dans un futur très proche, un groupe de brillants scientifiques ont créé une machine capable de contrôler nos rêves. Mais cette merveille technologique a été dérobée. Pour éviter le chaos et sauver l'humanité, Paprika doit découvrir qui sont les coupables et empêcher ces terroristes du rêve de contrôler nos esprits.